Дисциплины:
Курсовая работа
На тему:

Фруктозо-1,6-бисфосфатальдолаза класса I как белок ответа на стресс в E.coli.

Дисциплина: Биохимия
ВУЗ:МГУ имени М.В. Ломоносова
Формат: Word Doc

Просмотров: 1001 Добавлено: 2014-06-23




Часть текста

Оглавление

Стр.

Список использованных сокращений

3

1.

Введение

4

2.

Обзор литературы:

Фруктозо-1,6-бисфосфатальдолаза класса I как возможный белок ответа на стресс в Е. coli

4

2.1.

Классификация альдолаз

4

2.2.

Экспрессия FbaB в различных организмах

6

2.3.

Предполагаемые функции FbaB в бактериальной клетке

8

3.

Исследовательский проект:

Выявление функциональной роли фруктозо-1,6-бисфосфатальдолазы класса I в E.coli

9

3.1.

Определение видов стресса, в ответе на которые в E.coli может участвовать FbaB

10

3.2.

Определение экспрессии FbaB на разных стадиях клеточного цикла

11

3.3.

Определение каталитической активности FbaB на разных стадиях клеточного цикла

12

3.4.

Локализация пространственного распределения FbaB в клетке

12

3.5.

Выявление белковых партнёров FbaB в E.coli

13

4.

Экспериментальная часть:

Влияние нокаута гена FbaB на адаптацию E.coli к различным видам стресса

14

4.1.

Оборудование и реактивы

14

4.2.

Методики

14

4.3.

Результаты

15

5.

Список литературы

16

Введение.

Фруктозо-1,6-бисфосфатальдолазы – ферменты, участвующие в гликолизе и глюконеогенезе. Они присутствуют во всех известных живых организмах и подразделяются на два класса, I и II, различающиеся по структуре и механизму каталитического действия. Большинство эубактерий в качестве основной (или единственной) гликолитической альдолазы используют белок FbaA, то есть альдолазу класса II. Однако в геномах некоторых бактерий, включая E.coli, имеется также ген альдолазы класса I, или FbaB. В нормальных условиях роста эта альдолаза является минорной формой. Повышенная экспрессия FbaBнаблюдается в стрессовых условиях: при недостатке питательных веществ или воды в питательной среде, при переходе в стационарную фазу роста и т.п. Этот факт позволяет предположить, что FbaB в этих видах бактерий, помимо основной каталитической функции, выполняет также роль адаптивного белка, помогающего бактерии выживать в стрессовых условиях. В данной работе приведен обзор литературы и предложен проект исследования с целью выяснить, в каких именно видах стресса участвует FbaB, а также выявить другие возможные функции этого фермента в E.coli.

Результаты

В экспериментальной части работы удалось измерить только скорости роста штаммов E.coli в нормальных и слабокислых условиях, т.к. в сильнокислой среде, по-видимому, к концу времени измерения клеточные культуры не успели выйти из индукционного периода. Графики полученных зависимостей для контрольного штамма и ?fbaB показаны на Рис. 3. Тангенсы угла наклона прямых участков составили: (…) Из полученных результатов можно сделать вывод, что альдолаза I класса FbaB не нужна клеткам E.coli ни для роста в нормальных условиях, ни для адаптации к слабокислой среде.