 | На тему: | Фруктозо-1,6-бисфосфатальдолаза класса I как белок ответа на стресс в E.coli. |
| Дисциплина: | Биохимия | |
| ВУЗ: | МГУ имени М.В. Ломоносова | |
| Формат: | Word Doc |
Просмотров: 1407 Добавлено: 2014-06-23
Часть текста
Оглавление |
Стр. |
|
Список использованных сокращений |
3 |
|
1. |
Введение |
4 |
2. |
Обзор литературы: Фруктозо-1,6-бисфосфатальдолаза класса I как возможный белок ответа на стресс в Е. coli |
4 |
2.1. |
Классификация альдолаз |
4 |
2.2. |
Экспрессия FbaB в различных организмах |
6 |
2.3. |
Предполагаемые функции FbaB в бактериальной клетке |
8 |
3. |
Исследовательский проект: Выявление функциональной роли фруктозо-1,6-бисфосфатальдолазы класса I в E.coli |
9 |
3.1. |
Определение видов стресса, в ответе на которые в E.coli может участвовать FbaB |
10 |
3.2. |
Определение экспрессии FbaB на разных стадиях клеточного цикла |
11 |
3.3. |
Определение каталитической активности FbaB на разных стадиях клеточного цикла |
12 |
3.4. |
Локализация пространственного распределения FbaB в клетке |
12 |
3.5. |
Выявление белковых партнёров FbaB в E.coli |
13 |
4. |
Экспериментальная часть: Влияние нокаута гена FbaB на адаптацию E.coli к различным видам стресса |
14 |
4.1. |
Оборудование и реактивы |
14 |
4.2. |
Методики |
14 |
4.3. |
Результаты |
15 |
5. |
Список литературы |
16 |
Введение.
Фруктозо-1,6-бисфосфатальдолазы – ферменты, участвующие в гликолизе и глюконеогенезе. Они присутствуют во всех известных живых организмах и подразделяются на два класса, I и II, различающиеся по структуре и механизму каталитического действия. Большинство эубактерий в качестве основной (или единственной) гликолитической альдолазы используют белок FbaA, то есть альдолазу класса II. Однако в геномах некоторых бактерий, включая E.coli, имеется также ген альдолазы класса I, или FbaB. В нормальных условиях роста эта альдолаза является минорной формой. Повышенная экспрессия FbaBнаблюдается в стрессовых условиях: при недостатке питательных веществ или воды в питательной среде, при переходе в стационарную фазу роста и т.п. Этот факт позволяет предположить, что FbaB в этих видах бактерий, помимо основной каталитической функции, выполняет также роль адаптивного белка, помогающего бактерии выживать в стрессовых условиях. В данной работе приведен обзор литературы и предложен проект исследования с целью выяснить, в каких именно видах стресса участвует FbaB, а также выявить другие возможные функции этого фермента в E.coli.
Результаты
В экспериментальной части работы удалось измерить только скорости роста штаммов E.coli в нормальных и слабокислых условиях, т.к. в сильнокислой среде, по-видимому, к концу времени измерения клеточные культуры не успели выйти из индукционного периода. Графики полученных зависимостей для контрольного штамма и ?fbaB показаны на Рис. 3. Тангенсы угла наклона прямых участков составили: (…) Из полученных результатов можно сделать вывод, что альдолаза I класса FbaB не нужна клеткам E.coli ни для роста в нормальных условиях, ни для адаптации к слабокислой среде.